Les espèces phares
Le climax de Maromizaha est de type forêt dense ombrophile. L’aire protégée abrite 3 types d’habitats naturels : la forêt primaire, la forêt secondaire et le savoka ou forêt en régénération après culture sur-brûlis.
La végétation appartient à différents types phytogéographiques : la flore du vent, la zone éco-floristique orientale de basse et moyenne altitude, et la forêt humide. On y recense 13 familles de plantes avec 26 espèces dont 88% sont endémiques de Madagascar.