Les espèces phares
La Réserve Spéciale d’Ambatovaky est caractérisée par une végétation naturelle composée de forêt dense humide de basse et de moyenne altitude. Elle assure la connectivité biologique entre le Parc National Masoala en passant par Parc Naturel Makira, le Parc National Mananara-Nord et le Parc National Zahamena.
La Réserve Spéciale d’Ambatovaky abrite 31 espèces de mammifères dont 11 lémuriens, et 109 espèces d’oiseaux. L’herpetofaune est représentée par 75 espèces (reptiles et amphibiens).
La flore est représentée par 49 espèces 92% sont endémiques de Madagascar réparties dans 31 Familles.